Free Access
| Issue |
Vet. Res.
Volume 31, Number 6, November-December 2000
|
|
|---|---|---|
| Page(s) | 583 - 602 | |
| DOI | https://doi.org/10.1051/vetres:2000142 | |
| How to cite this article | Vet. Res. (2000) 583-602 | |
DOI: 10.1051/vetres:2000142
Vet. Res. 31 (2000) 583-602
An individual modelling tool for consecutive clinical mastitis during the same lactation in dairy cows: a method based on a survival model
Patrick Gasquia - Odile Ponsb - Jean-Baptiste Coulonc
aUnité d'Epidémiologie Animale, INRA, 63122 Saint-Genès-Champanelle, France
bUnité de Biométrie, INRA, 78352 Jouy-en-Josas, France
cUnité de Recherche sur les Herbivores, INRA,
63122 Saint-Genès-Champanelle, France
(
Abstract:
The high number of clinical mastitis recurring within the same lactation in dairy cows
constitutes one of the factors of overdispersion in standard Poisson models. Our method,
based on biological parameters, i.e., recurrence hazard in relation to udder exogenous
infection (Rex) or recurrence hazard and rate in relation to endogenous infection (Ren),
produced a model capable of integrating a possible change of state in the udder after
clinical mastitis. This model was based on a study of the time intervals between
successive clinical episodes, both types of risk being considered in the form of a
distribution mixture in the survival model. The modelling tool allowed to determine
the factors that specifically act on either one of the potential risks and estimated
the distribution of the number of clinical mastitis per lactation, as well as the
distribution of when mastitis occurs. Estimation results obtained by this method in
an experimental herd were compared with those from more classical models with or
without random individual effects. The distribution of the number of mastitis per
lactation estimated by our method was well-fitted to the data and the method identified
variation factors which were relatively standard in this type of study: lactation number,
lactation stage and calving month. Prediction results obtained in another experimental
herd with more recent data without parameter re-estimation demonstrated the adequacy of
the model in fitting observed data. This modelling method based on biological parameters
in a mixture of survival distributions was interesting to model clinical mastitis
recurring within the same lactation. However in the future it will also be important to
integrate the possible relationship between successive lactations and to apply this
model to other types of farming systems.
Keywords:
clinical mastitis / individual model / dairy cow / survival model / recurrence
Résumé:
Un outil de modélisation individuelle des mammites cliniques successives au sein d'une
lactation chez la vache laitière : une méthode basée sur un modèle de survie. Les nombres
élevés de mammites cliniques successives au sein d'une lactation chez des vaches laitières
constitue un des facteurs de sur-dispersion dans les modèles de Poisson usuels. Avec notre
approche fondée sur des paramètres biologiques : risque de récidive lié à une infection
exogène de la mamelle (Rex), risque et taux de récurrence liés à une infection endogène
(Ren), on obtient un modèle apte à prendre en compte un changement d'état de la mamelle
suite à une mammite clinique. Ce modèle est fondé sur l'étude des intervalles de temps
séparant les événements cliniques successifs, les deux types de risque étant pris en
compte sous la forme d'un mélange de distribution dans le cadre des modèles de survie.
L'outil de modélisation permet la mise en évidence de facteurs agissant spécifiquement
sur l'un ou l'autre des risques potentiels, et permet d'estimer la distribution du nombre
de mammites cliniques par lactation ainsi que la distribution de leurs instants
d'occurrence. Des résultats d'estimation obtenus à l'aide de cette approche dans un
domaine expérimental sont comparés aux résultats issus de modèles plus classiques avec
ou sans effet individu aléatoire. Notre approche montre une bonne adéquation de la
distribution estimée du nombre de mammites par lactation à celle observée, et la mise
en évidence de facteurs de variation relativement classiques dans ce type d'étude :
rang de lactation, stade de lactation et mois de vêlage. Des résultats de prédiction
obtenus dans un autre domaine expérimental avec des données plus récentes sans
ré-estimations des paramètres montrent l'adéquation du modèle pour ajuster des données
observées. Cette approche de modélisation fondée sur des paramètres biologiques dans le
cadre d'un mélange de distributions de survie, semble intéressant pour modéliser les
mammites cliniques au sein d'une même lactation. Cependant il serait important d'intégrer
dans le futur une possible relation entre lactations successives, et d'appliquer le modèle
à d'autres types de système d'élevage.
Mots clé :
mammite clinique / modèle individuel / vache laitière /
modèle de survie / récurrence
Correspondence and reprints: Patrick Gasqui
Tel.: (33) 4 73 62 42 65; fax: (33) 4 73 62 45 48;
e-mail: Patrick.Gasqui@clermont.inra
Copyright INRA, EDP Sciences